卵巢畸胎瘤的发病原因并不十分明确，可能与遗传因素、环境因素、疾病因素、染色体异常、生殖器和尿道缺陷等因素相关。卵巢畸胎瘤可以分为卵巢成熟畸胎瘤和卵巢未成熟畸胎瘤。卵巢成熟畸胎瘤好发于20~40岁的患者，属于良性肿瘤。卵巢未成熟期胎瘤好发于11~19岁的年轻患者，是一种恶性肿瘤，转移和复发率都比较高。
卵巢畸胎瘤的形成原因不明，可能与遗传有关，持续性的排卵可使卵巢上皮不断损伤与修复，容易发生细胞的增殖改变，不良生活习惯，不良饮食，精神过度紧张，压力过大容易造成体质免疫功能降低，体内酸碱不平衡，酸性体质从而发展为卵巢畸胎瘤。总之，卵巢畸胎瘤的发生机理不很明确。
这个病因一般都很多，特别是妇科疾病更为复杂。畸胎瘤是如何形成的？一般是与下列因素有关系：第一条，就是遗传和家族因素，约20%-25%的卵巢肿瘤患者的直系亲属中都有肿瘤患者。第二个，就是内分泌原因，卵巢囊肿多发生在未生产过的人或者未曾生育的妇女，卵巢肿瘤对妊娠有对抗作用，认为就是每日卵巢所致卵巢表皮上皮细胞反复破损，与卵巢肿瘤发生有关。另外，像乳腺炎、子宫内膜癌、乳腺癌多发生于卵巢肿瘤，因此这个几个疾病一般都相互存在的。再有生活方式，长期饮食结构，生活习惯不好，心理压力大，导致体内酸化，人体整个机能下降，免疫功能下降，从而发生卵巢异常增生导致卵巢囊肿，有的甚至会导致癌变。再有环境因素，像食物污染，蔬菜污染，家畜、家禽饲养过程中瘦肉精成分，都会导致卵巢瘤发生。像吸烟、喝酒还有电离辐射，也都会引起肿瘤的发生。
女性卵巢畸胎瘤的发病机制目前并不十分明确，但主要和下列急症情况有关系：第一，如果女性有自身免疫性疾病，就容易出现畸胎瘤。第二，受到遗传因素的影响。第三，女性体内缺乏雌激素，同样会引发畸胎瘤。卵巢畸胎瘤有恶变率，大概有5%，所以在确诊畸胎瘤之后，建议尽快采取手术方式进行切除治疗。
卵巢畸胎瘤形成的原因有：内分泌因素，生活方式原因，环境因素。1.内分泌因素卵巢肿瘤多发生于内分泌旺盛的生育年龄。持续性的排卵可使卵巢上皮不断损伤与修复，增加了卵巢上皮囊肿形成的机会。2.生活方式原因长期不良生活习惯，不良饮食，精神过度紧张，压力过大造成体质免疫功能降低，体内酸碱不平衡，酸性体质从而发展为卵巢组织异常增生，甚至癌变。3.环境因素中青年女性过量的服用激素、保健食品、抗衰老的食品及补品，导致肿瘤的高发性。
免疫因素导致卵巢畸胎瘤的形成。主要是女性患有合并或者自身免疫性疾病，可以通过血液检查出卵巢抗体的存在，从而就会导致卵巢畸胎瘤的产生。二、遗传性的因素导致卵巢畸胎瘤的形成。一般情况下，由于女性先天性的生殖细胞少，影响到卵泡壁道加速，从而导致x染色体的异常。因此遗传性因素使卵巢畸胎瘤的形成。三、内分泌所导致的卵巢畸胎瘤形成。主要为女性患者的雌激素缺乏。四、物理性的因素导致畸胎瘤形成。一般情况下，女性由于感染或者手术不当而造成性腺激素分泌少，或者性腺激素受体缺陷，从而导致卵巢畸胎瘤的形成。
卵巢畸胎瘤现在的发病因素和发病机制还不明确，可能与神经系统、内分泌因素、生活环境，以及遗传因素、生殖器和尿道的先天缺陷有关，另外还和染色体异常也有关系。还有些诱发的因素，卵巢畸胎瘤又分为成熟畸胎瘤和未成熟畸胎瘤，成熟畸胎瘤的发病多在20-40岁，未成熟畸胎瘤的发病多见于年轻的患者，平均年龄是11-19岁。另外卵巢畸胎瘤有家族史，卵巢畸胎瘤可以是单侧的也可以是双侧的，而一般情况下发现了卵巢畸胎瘤，它的治疗方法主要是以手术治疗为主。
它是由生殖细胞在迁移和发育过程中的异常增殖和聚集引起的。在人类胚胎发育过程中，存在一种具有多能分化潜能的多能细胞。当整个胚胎在不同阶段被分离或脱离时，就会发生胚胎异常，这就使得细胞基因发生变异和异常分化。认为早期胚胎发生分离和脱落形成畸胎瘤，晚期胚胎发生内胚层、中胚层和外胚层异常分化组织形成畸胎瘤。根据畸胎瘤的病理，分为成熟畸胎瘤和未成熟畸胎瘤，成熟畸胎瘤由分化成熟的组织组成，未成熟畸胎瘤主要由胚胎发育过程中的未成熟组织组成。
形成原因：1、遗传因素，主要是先天性生殖细胞数少，造成卵泡闭锁加速，导致了X染色体异常；2、免疫因素，女性患者常常合并其它自身免疫性疾病，使血液中可以检出卵巢抗体；3、内分泌不足，患者的雌激素比较缺乏，潜在的卵巢雄激素分泌不足，导致肾上腺产生甾体激素能力轻度缺陷；4、物理因素，手术不当，感染等都会造成性腺激素分泌缺陷，或促性腺激素受体或受体后缺陷，这些都是导致卵巢畸胎瘤的原因之一。
卵巢畸胎瘤可能是由于生殖细胞的异常增生造成的。卵巢畸胎瘤是指，生长在由生殖细胞异常增生集聚形成的肿瘤，是常见的卵巢生殖细胞肿瘤。临床上常见的大部分是良性的，但是未成熟性的畸胎瘤变成恶性的概率也相对比较高。可能与内分泌因素、生活方式、环境、遗传因素等有关。最主要的临床症状是腹痛、腹部包块、发热、乏力等。