菊花茶是一种寒性的饮品，而且具有一定的刺激性，是有可能对胃黏膜造成伤害的，如果病人胃肠不好应尽量避免喝菊花茶。胃肠不好的病人应避免辛辣、刺激、油腻、难消化、易产气、粗纤维的食物和饮料，例如酒、浓茶、浓咖啡、碳酸饮料以及一些具有刺激性的饮品都需要少喝。
菊花茶有散风清热，平肝明目，解毒的功效，喝菊花茶有一定的去火作用，但不会对胃有伤害。如果喝菊花茶后，出现胃不好的情况，一般与饮茶没什么关系，往往是慢性胃炎导致的，如果患了慢性胃炎，可以通过饮食调理慢慢自愈，平时可以多喝白开水，有温胃去火的作用，饮食要清淡，不吃辛辣刺激的食物，不吃生冷寒凉的食物，不要暴饮暴食，多吃一些温热的易消化的食物。
胃病患者应少喝菊花茶，尤其是脾胃虚寒者。由于菊花茶性寒，容易引起脾胃虚寒者消化不良，导致胃部不适，甚至加重胃部负担。就菊花茶而言，它不应该长时间连续饮用，一般适合三到五天。体质冷，需要喝菊花茶的人，不妨加入枸杞，合成菊花茶的凉性。因此建议最好是不要喝太多的菊花茶。